Sin recursos para proteger este complejo arqueológico, las áreas que han sido desenterradas están en peligro por las lluvias que caen en la región entre los meses de diciembre y marzo. Preservar Wari, según señalan los expertos requiere de un tratamiento especial, es decir, formar una unidad ejecutora que tenga un presupuesto permanente y continue los trabajos de recuperación de este complejo arqueológico.
La importancia de Wari en la historia de la sierra central de América del Sur es fundamental. Se trata del primer imperio andino que gobernó un amplio territorio entre Lambayeque y Cajamarca por el norte hasta Moquegua por el sur y en el este ingresaron a los valles de selva alta. Su capital fue la actual ciudad enterrada de Wari, ubicada a 30 kilómetros de la ciudad de Ayacucho.
Muchos han considerado que la ciudad de Wari puede compararse con otras ciudades enterradas. En las distintas culturas existen ciudades que fueron sepultadas, por desastres naturales, como la explosión del Vesubio que sepultó con cenizas volcánicas la ciudad de Pompeya. Otras fueron abandonadas por sus habitantes, principalmente por epidemias o pandemias, como la peste negra. No existe una fuente que explique que pasó con Wari.
La tarea que tienen por delante los arqueólogos, especialmente los egresados de la Universidad de Huamanga, es continuar con los trabajos de excavación para ir poniendo en evidencia los pasadizos, pasajes y calles que tenía esta ciudad y sus templos y palacios.
Pero eso sólo será posible, como han reiterado, si se crea la unidad ejecutora. Los arqueólogos, consideran que Wari tiene no sólo un valor cultural, como es conocer esa etapa casi desconocida entre los siglos VII y XII D.C. Indican que también sería un atractivo turístico y para eso se requiere su puesta en valor.
Justamente, este es el otro gran objetivo de recuperar Wari. Otros países, entre estos México, desde comienzos del siglo anterior dieron una gran importancia a la recuperación de su valioso patrimonio monumental. Debemos aprender de esos países en este campo, porque el Perú ha sido el territorio donde han florecido importantes culturas, siendo la primera Caral, tres mil años antes de Cristo, hasta el Imperio del Tawantinsuyo, justo antes de la conquista española.



